Le 3939 comporte deux niveaux de réponse.
<span class="miseenevidence">Le premier niveau</span> accueille les appels, identifie les sujets et fournit des réponses aux questions simples et fréquentes. Le contenu des réponses données par le premier niveau peut être trouvé dans les pages du site service-public. Ce niveau oriente également les usagers vers d'autres centres de contacts traitant de points ne relevant pas du périmètre du 3939.
Pour certains sujets plus complexes, l'appel est transféré sans rupture de communication à des informateurs spécialisés (<span class="miseenevidence">deuxième niveau</span>), mis à disposition par les ministères en charge du droit du travail, de l'intérieur, de la justice, du logement et de l'urbanisme et de la consommation.